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房产证红本就是商品房产证，是在国土局备案过 可以正常交易的，绿本是属于小产权的，比如农民房，集资房，福利房等。在国土局有记录，但是不能正常交易，所以绿本目前是不可以做抵押贷款的。
主要区别是:绿本房产证不能上市交易，如果补交土地税以后，绿本可以转换红本(国家建设部监制的中华人民共和国房屋产权证)。
城市房产是建设在国有土地上的，而农村房产是建设在集体土地上的。因为我国的土地制度，集体土地未转化为国有土地前是不能流通的，因此农村房产只能在同一农村集体经济组织的成员中流通，而城市房产可以在市场上流通。
红色的房产证全称叫《房屋所有权证》，绿色的房产证全称叫《房地产所有权证》。
1、《房屋所有权证》通常简称房产证，购房者通过交易，取得房屋的合法所有权，可依法对所购房屋行使占有、使用、收益和处分的权利的证件。即《房屋所有权证》，是国家依法保护房屋所有权的合法凭证。与之配套的是《国有土地使用权证》，简称土地证，二者共同使用，组成完整的房地产配套权益。
2、《房地产所有权证》是《房屋所有权证》与《国有土地使用权证》“两证合一”的结果，是一个形象的称呼，总体意思是成为房地产权指土地使用证和房屋所有权证合二为一证。在上海、深圳、重庆等地，一套房子只有一张证已经实施多年。